细胞类型特异的基因调控网络研究获进展

生物体内各种类型的细胞怎么构成各自特异的调控网络进而获得特异的功用是生命科学研讨中一个基础而且重要的问题。遍及的观念以为细胞类型特异表达的基因，尤其是转录因子，是构成细胞类型特异的调控网络的主要原因。但不同类型细胞间含有很多一起表达的基因，这些不同类型细胞中遍及表达的基因怎么参加细胞类型特异的调控网络尚属不知道。
为处理这一问题，中国科学院遗传与发育生物学研讨所王秀杰研讨组与中国科学院动物研讨所周琪课题组协作，通过系统比较小鼠胚胎干细胞（mESC）与多种体细胞的转录组数据，发现了104个能够使用mESC特异的选择性启动子调控其在mESC中表达的基因。这些基因在mESC和不同类型体细胞中均遍及表达，但在mESC中通过mESC特异的选择性启动子而发生mESC特异表达的新的转录本（SATS isoform）。这些SATS转录本一般与其对应基因的广谱表达的转录本（common isoform）在5'端的首个或首几个外显子存在序列差异，而其它序列相同。超过60%的SATS转录本具有与其对应的common转录本不同的读码框，部分来自表观遗传润饰和发育调控基因的SATS转录本发生了重要功用域的改变。mESC中表达的SATS转录本的转录大多受到多能性中心因子Oct4、Sox2及Nanog的调控，功用研讨表明SATS 转录本参加调控mESC多能性的保持，敲低部分SATS 转录本后导致mESC分解。这些结果表明细胞类型特异的转录因子能够通过调控选择性启动子，使得广谱表达的基因发生细胞类型特异的转录本，从而使广谱表达的基因获得参加树立或保持细胞类型特异特征的新功用。
该项研讨成果于7月27日在线发表于EMBO Reports 杂志（DOI: 10.15252/embr.201541476）上。王秀杰研讨组已结业的博士生冯桂海、助理研讨员佟曼和周琪课题组的夏宝龙为该论文的一起*作者，王秀杰与周琪为一起通讯作者。该项目得到国家重点基础研讨发展计划（“973”计划）、中科院干细胞与再生医学战略性先导专项及国家自然科学基金等项目的赞助。
干细胞特异的转录因子通过选择性启动子调控广谱表达的基因发生干细胞特异的转录本